衛生署臺南醫院支持「慢性病連續處方箋釋出」，成為社區信賴的醫院為首要任務。衛生署臺南醫院與台南市藥師公會及社團法人台南縣藥師公會，為提升醫療水準及改善民眾的醫療服務品質，於民國102年7月12日，由臺南醫院李伯璋院長與台南市藥師公會林景星理事長及社團法人台南縣藥師公會黃昭勳理事長代表雙方簽訂轉介醫療合作契約，並特別邀請衛生局林局長聖哲蒞臨，林聖哲局長對於衛生署臺南醫院與台南市藥師公會及社團法人台南縣藥師公會簽訂醫療合作契約表示肯定，雙方簽訂合約後可提供藥師公會所屬會員及社區藥局的病患更完整的用藥資訊及健全轉介網絡。

台南市藥師公會及社團法人台南縣藥師公會所屬會員及社區藥局藥師，如有病患診療上的需要，透過藥師轉介，衛生署台南醫院亦將秉持其專業能力提供所需要之醫療服務，使其得到妥善與高品質的醫療服務。同時，衛生署臺南醫院支持「慢性病連續處方箋釋出」，讓社區民眾用藥更有保障、領藥更便捷。

李伯璋院長表示衛生署臺南醫院不斷提升醫療品質，加強醫療設備，電腦斷層、血管攝影。醫師部分，除本院資深主治醫師以外，有成大教授級、主任級醫師在臺南醫院看診、開刀。衛生署臺南醫院以醫學中心的品質，真心服務搏感情，來經營台南病院、加強經營社區，守護大台南市民一輩子的健康，做為大台南市民的好厝邊。