針對報載「停灌補償只給地主」乙節，行政院農業委員會農糧署特予澄清，明(104)年第1期稻作規劃停灌面積 41,576公頃 ，政府對停灌區提供補償方案，補償費由實際耕作農民領取，並非如報導給予地主之情形。至於現耕農友依租賃條款或協議條件，已將租金付予地主，本措施在99年乾旱停灌補償作業已建立良好互信基礎，期外界勿散布不實傳言。

農糧署說明，目前稻作栽培大部分為自耕農友，部分農友配合小地主大佃農政策，出租予專業農民從事耕作，簽訂租賃契約，自98年推動以來，地主與承租人已具有良好互動與信任基礎。

有關停灌補償費依規定係撥付實際耕作人(即自耕農或承租人)帳戶，實際耕作人(承租人)已依契約約定付予地主租金。該署進一步指出，99年間嘉南、苗栗乾旱停灌辦理補償時，即依此模式協商及運作，並無爭議情事。而明(104)年停灌補償作業，該署將透過地方政府及當地分署予以協助。

農糧署表示，目前全台大佃農人數1,666人，耕作面積 15,024公頃 ；對於停灌區內受影響大佃農計有323人，面積約 2,800公頃 ，該署將加強輔導與協助，對於已辦理之政策性農業專案貸款提供寬限措施，如農機貸款及小地主大佃農貸款等，在停灌期間償還貸款有困難者，本金償還期限可展延 6 個月，展延期間免收利息，予以協助。