日有關「全台臭氧污染急速惡化」的報導，環保署指出98年1~9月全台臭氧不良日比率為1.74%，較97年同期的1.6%來得高，但較96年同期的3.1%低了許多，可見近三年來並無臭氧污染急速惡化之現象。環保署再近一步分析，98年1月~9月全台平均溫度及日照時數均較97年同期高，此一氣象條件容易造成臭氧生成，而本縣馬公測站亦有此一情形，僅是指標污染物為臭氧的比例增加，並非空氣品質變差。

澎湖縣環保局彙整98年度1月~10月馬公測站304天的資料，98年度空氣品質良好的日數有157天，占統計日數的51.6%，空氣品質良好日數比例是近三年最高(95年50.4%、96年51%、97年47.8%)，良好的空氣品質是我們大家共同擁有的資源，維持良好的空氣品質，是你我一起努力的目標，只要你我能夠從日常生活中做到加強居家鄰近路面砂塵清掃、不要露天燃燒廢棄物、多多搭乘公共交通工具、減少使用機車及汽車，只要養成這些習慣，都是對維持良好空氣品質的大貢獻，請鄉親一同維持，讓菊島空氣品質持續維持排列在全國最佳的名單中。