本案緣起97年間雲林縣斗六地區有多項公所工程「斗六市台西客運旁平交道地下化工程、斗六市明德里多功能活動中心興建工程、斗六國中雲林國中通學步道改善工程」，期間有雲林縣某代表會陳姓主席(治平對象)利用其身分及職權，對工程得標廠商勒索之不法行為，如該廠商稍有不順從，即命其組織圍事小弟林00、劉00等人，以汽油彈縱火燒毀廠商施工機具及恐嚇之暴力手段，令得標廠商屈服在其威脅下，勒索新台幣數佰萬元得逞，或對得標廠商以恐嚇之手段，要求指定小包商轉承包工程，以達從中獲利，由於陳姓主席與其組織成員作風剽悍，使被害廠商均敢怒不敢言，致斗六地區工程長期遭壟斷與處在暴力陰影下，且該組織也從事暴力討債之不法情事，其中一位成員在99年2月間在討債時與人發生槍戰，中槍身亡。

本案經臺灣雲林地方法院檢察署指揮雲林縣警察局專案小組、刑事警察局、調查局中部機動組、雲林縣調查站等單位偵辦，將其列為治平對象全力查緝，經過多月之蒐證後，於99年6月23日見時機成熟，分別對斗六市代表會及組織成員之住所(共7個點)同步執行搜索之行動，並帶回涉案之陳姓代表主席與組織成員共8人，經訊問後，全案依涉嫌違反組織犯罪防制條例、暴力恐嚇及貪污治罪條例等罪嫌，移送臺灣雲林地方法院檢察署偵辦。