臺南市政府環境保護局繼98年度榮獲環保署海洋污染防治考核第二組優等成績，再次於99年度以優異表現在全國25縣市中榮獲環保署海洋污染防治考核第二組優等成績。

榮獲全國優等的殊榮，顯見南市環保局團隊結合大臺南地區的市民朋友們共同為海域環境的污染防治，展現出豐碩的成果。環保局執行海洋污染防治工作有（1）一般海域監測共10站，水質監測項目多達12項，每季監測1次，統計去年完成40點位檢測；（2）國際級瀕臨滅絕候鳥黑面琵鷺保育地監測共7站，水質監測項目多達13項，每月監測1次，統計去年完成84點位檢測；（3）港口污染稽查，於蚵寮、北門、馬沙溝、將軍、青山、下山等6個漁港共稽查575次；（4）船舶稽查，配合沿岸執行機關-海巡署第五二岸巡大隊進行船舶稽查共153船次；（5）推動社區及企業認養海灘，計有樹林、中寮、竹港、龍山、大寮、錦湖、永隆、蚵寮、永華等社區發展協會、馬沙溝社區環保義工隊、奇美實業股份有限公司等共計11個民間團體；（6）製作海洋污染宣導摺頁，寄發給漁民；（7）辦理春季及秋季清潔海洋環境淨灘活動共2場次；（8）成立港區巡守隊或船舶志工巡守隊，真理大學巡守隊每月定期至七股六孔碼頭進行水質檢測，以掌握水質變化趨勢；（9）辦理海洋污染防治教育宣導活動之宣導人數多達2050人；（10）調查海洋環境敏感指標ESI，調查海岸線長度計36公里，其中黑面琵鷺野生動物保護區、七股潟湖生態敏感區、四草濕地為敏感度較高的地區，應列為優先保護。另與民眾切身相關的海灘遊憩戲水之水質清淨程度，臺南市馬沙溝海灘水質經環保署於99年全年夏季連續監測10次，監測結果顯示臺南市馬沙溝海灘水質100%均屬「優良」等級。

臺南市環保局局長張皇珍表示，行政院環境保護署每年夏季時進行海灘夏季水質監測，尤其馬沙溝海域水質經環保署10次監測結果皆屬「優良」等級，在全國23處遊憩海灘當中為100%水質優良等級，顯見海洋污染防治的成果已提供給民眾一個安全優質的親水空間，更進一步來說，可提供民眾共享珍貴豐富的海洋資源。

張皇珍局長指出，近日景氣復甦加上縣市合併，環保局將動員全部人力不分晝夜加強查緝，並利用假日稽查行動、夜間稽查行動、不定期擴大稽查行動，以維護大臺南水域之清淨，進而強化海域污染防治。