過去，由於上游鳥松仁美地區皮革廠刺鼻惡臭廢酸污水排放，再加上沿岸工廠廢水和鳳山地區家庭廢水污染，使得鳳山溪讓市民不願親近，甚至還有「黑龍江」的戲稱。

水利局表示，市府過去已對鳳山溪流域進行多項整治工程，包括大東橋至昭南橋段兩岸景觀綠美化、污水截流及輸水工程、百榕園及八仙公園與垃圾山之景觀橋梁改善、大智橋至博愛橋及昭南橋至民安橋之河道改善等工程，對於鳳山溪的水質及周邊景觀已有大幅改善。惟仍偶有水質污黑惡臭的情況發生。為此，市府除請環保局針對鳳山溪沿線工廠加強稽查取締外，水利局正委託顧問公司針對鳳山溪流域整體進行水質水量之檢測及評估規劃整治策略（包含加強底泥清淤頻率、流域內既有設施功能提升、強化支流排水截流及持續推動下水道用戶接管工程等），希望能在短期內使鳳山溪達到陸域水體戊類水質標準(溶氧值≧2mg/L、無漂浮物且無油污等），進一步達到全河段無缺氧、不發臭。並藉由整體性檢討及評估，為鳳山溪流域污染整治奠定基石及注入新的活力。

此外，縣市合併前，原高雄市前鎮河設置高公截流站，以避免上游鳳山溪污水進入高雄港，污染港區與海域。目前高公截流站以每日約200,000噸之截流量將水輸送至中區污水處理廠，隨著用戶接管率逐漸上升，中區污水處理廠已無法負荷，水利局目前針對未來高公截流站原址廢除進行妥適之評估及規劃，期望加速達到鳳山溪-前鎮河全線通水之目標。

為了進一步打造高雄成為水與綠之生態之城，市府團隊戮力向既定目標邁進，期能藉由河岸整治及污水下水道建設雙軌進行下，使鳳山溪水變得更潔淨，配合兩岸景觀綠美化工程，塑造河岸新藍帶。