針對環保署公布雲林縣北港溪列為污染最為嚴重的河川，蘇縣長表示是縣府做得不夠，也宣示強力改善的決心。對於沿岸的養豬場，將全面要求設置豬廁所，如未設置者環保局將不定期每週三次的強力稽查，如發現污染立即開罰。對於家庭廢水污染，除加快污水下水道建置外，也請中央速核定補助斗南污水下水道的規劃經費，期藉由對於污染的源頭管理，早日洗刷北港溪污染的惡名。

蘇縣長1日上午邀集各單位研商改善作為時，強烈要求各單位應拿出具體作為，展現政府公權力，只要是對民眾有益的，都應全力去維護。而北港溪流經雲、嘉二縣，事涉跨縣市及跨部會職權，中央也應召開跨縣市河川污染整治協調會議。

蘇縣長會中也強烈要求環保局於沿岸養豬場全面設置豬廁所，並請警察局協助要求各管區提報沿岸所有養豬場及工廠，未來如未設置豬廁所者，環保局將不定期強力稽查。而生活廢水是北港溪最大污染源，縣府有決心要來改善，也希望中央能在經費上全力來支援，地方也能全力來配合，共同努力來改善我們的生活環境。

雲林縣環保局指出，北港溪為中央管河川，是雲林、嘉義二縣界河，其主要污染源包括三大部分，最主要為生活廢水，佔58.7％，畜牧廢水佔38.4％，事業廢水佔2.9％。在畜牧廢水部分，北港溪流域雲林縣計列管194家畜牧業，約16萬7千多頭，雖然縣府長期的輔導及要求，但改善效果不佳。依據去年在新虎尾溪推動的豬廁所計畫，成效良好，未來將在北港溪流域全面來推動設置，從源頭減量方式，以徹底改善水質。

水利處也指出，北港溪主要流經斗六、斗南、虎尾及北港，目前在各鄉鎮已陸續在規劃建設下水道工程、截流及水質淨化工程，未來完成後對水質改善將有相當助益。在斗六污水下水道工程，目前正積極在用戶接管施工；虎尾鎮下水道工程已於99.7完成審核，目前正用地協調中；北港鎮下水道工程正在設計中，在今年應可正式完成；斗南鎮污水下水道將納入營建署第五期建設計畫內。水利處也指出，雲林縣灌溉水源主要來自嘉南大圳濁幹線，甚少引自北港溪做為灌溉用水，對於本縣農作物並無影響，民眾應可放心。