大臺南合併後，共有13家責任醫院積極協助市民的精神衛生、心理健康及自殺防治與藥癮戒治等醫療服務工作，衛生局為保障就醫民眾之權益及提昇醫療服務品質，每年會針對各醫院於精神醫療、心理健康促進及自殺防治、藥癮戒治及家庭暴力及性侵害被害人通報及驗傷採證等工作，聘請專家委員至各醫院進行現場實務輔導考核及書面審查，並透過專家意見提出具體改善方案，進而提高醫院醫療照護之水準，以確保病人安全。

臺南市政府於2月16日永華市政中心由賴清德市長親自頒發獎座予100年度考核績優醫院，獲獎醫院如下：國立成功大學醫學院附設醫院獲得獎項有：(1)心理衛生暨自殺防治業務特優、(2)毒品危害防制業務特優、(3)家庭暴力及性侵害防治業務特優、(4)精神衛生推動優異獎。行政院衛生署嘉南療養院：(1)毒品危害防制業務特優、(2)精神衛生推動優異獎。台南市立醫院獲得獎項有：(1)心理衛生暨自殺防治業務特優、(2)精神衛生出院準備服務優異獎。奇美醫療財團法人奇美醫院獲得「家庭暴力及性侵害防治業務特優」。奇美醫療財團法人奇美醫院台南分院獲得「精神衛生暨性侵害加害人防治業務最佳服務獎」。郭綜合醫院獲得「家庭暴力及性侵害防治業務有功團體獎」。高雄榮民總醫院臺南分院獲得「精神衛生暨毒品危害防制業務最佳配合獎」。市長特別感謝獲獎醫院的齊心協力，並期勉各醫院繼續提供高品質的精神及心理醫療服務，讓臺南市市民更健康、更安全。