湖西鄉國家級青螺濕地及馬公市地方級菜園濕地，兩處已漸為澎湖生態旅遊、環境保護及學術研究等工作的重要據點與展示地方。尤以近年來，國民休閒與旅遊品質意識的提高，生態與自然環境保護的結合，已成為當今國民生態旅遊及教育的重點及工作。

澎湖縣政府農漁局已於近年擬定對國家與地方級重要濕地的保育行動方針。除了善加維護與規劃兩處濕地外，也妥善運用民間團體及學校學術資源，如野鳥學會之「陸域動物資源調查與棲地巡守」及國立澎湖科技大學之「植物群落監測與植物復育調查」以及研究等，國立屏東科技大學於溼地所種植海茄苳、欖李、五梨跤之紅樹林生長及族群動態監測，並於濕地底棲環境善加利用規劃，結合濕地周圍的海岸地形以及潮間帶產業活動與砂嘴等生態景點，而帶動濕地地區之觀光活動與發展。

此期間，於青螺濕地及菜園濕地漁塭塭堤週邊種植之紅樹林更大幅改變周遭環境的生態變化與物種的歧異度。而本縣罕見的倒立水母、流蘇菜、日本絨毛蟹等生物，也出現在菜園濕地裏。在濕地出現之鳥類以鷸科、鴴科、鷺科及雁鴨科等鳥類為主，因此澎湖縣政府農漁局設有賞鳥亭、賞鳥牆、賞鳥屋等觀鳥設施並且已重新粉刷、整理，以及製作新的解說牌，是目前賞鳥和戶外教學活動的良好場所。於此靜靜地來，賞鳥與生態保育環境已漸趨成熟更顯成效的青螺濕地及菜園濕地，相信會讓人更驚奇於其生物之多樣性。