嘉義縣的C型肝炎病例更是位居全國之冠，治療C型肝炎唯一方法就是注射干擾素合併抗病毒藥物使用，以往民眾須自行負擔龐大費用，還須做切片檢查，費用昂貴，副作用又大，部分民眾無法負擔而拒絕治療或中途放棄；但現在C肝治療已納入健保給付，而且病患在朴子醫院接受治療已有很好的治療成效。

署立朴子醫院院長吳彬安表示，台灣約有3%的C型肝炎患者，多集中沿海地區，目前B、C肝治療之費用已納健保給付，使用治療長效干擾素(Pegasys或PEG-INTRON1)治療C肝及其他副作用較少之治療B肝口服藥物(Zeffix肝安能；Baraclude貝樂克等藥物)，使得病人接受度高且有信心。使用過程中因個人體質而異有不同程度的副作用，如食慾變差、倦怠、皮膚癢皆可接受及處裡。