高雄市五號排水溝為旗山市區主要集水路，兼納二、三、四號排水溝，流經市區於旗山橋下排入旗山溪。近年來因氣候變遷，在汛期來臨時豪大雨集中、強度增強且停留時間拉長，旗山區每逢汛期暴雨水位高漲時，五號排水溝無法容納瞬間過多雨水，造成低漥地區積淹水。

旗山區五號排水溝抽水站設置於五號排水溝出口，位於中華路及延平一路交會口，集水面積約322公頃，已於10月中完工；其主要整治策略為將颱風豪雨期間，流入五號排水溝內之雨水以機械方式強制排至旗山溪，增加五號排水溝通洪量以減少街道積水。本抽水站總抽水量每秒可抽排12噸雨水流至旗山溪，可明顯改善現況淹水情形。

五號排水溝目前因民眾任意丟棄垃圾，雖可由撈污機組撈除，但較細小之垃圾流入抽水井將易損壞抽水機組。高雄市政府水利局呼籲民眾，勿將垃圾丟棄於五號排水溝內，以維護抽水機組於洪汛期間可順利操作，提升當地居民之生命財產安全。

此外，水利局目前正積極研擬改善五號排水溝方案，規劃五號排水溝下游出口段以及與二號排水溝之匯流段可行之拓寬空間，增加排水量；現有排水溝底清淤及填平低窪處，使排水更加平順。據水利局表示，希望相關工程能於102年2月底前進行施工，再配合五號排水溝抽水站之運作，相信能大幅改善當地淹水情況。