六輕揮發性有機污染物（VOCs）排放量計算，環保署認為雲林縣政府捏不實數據，誤導提供環保團體引用，企圖影響六輕擴廠案環評結果，要求雲林縣長蘇治芬登報向雲林縣民道歉。雲林縣政府則強調，所有排放數據都是有所本，若有爭議或疑點可邀專家學者和專業單位一起討論釐清。

針對台塑石化申覆六輕擴廠環境影響評估案，環保署認為雲林縣政府發函給環保署的公文，指六輕離島工業區揮發性有機污染物（VOCs）排放量達到4341公噸，甚至每年超過九千公噸的數據明顯有誤，並誤導環保團體據此要求環保署不能再接受六輕擴廠審查，並指審查涉嫌違法。環保署長沈世宏因而要求雲林縣長蘇治芬登報道歉。

雲林縣長蘇治芬回應表示，公文數字均有依據，雲林縣政府嚴正聲明，有關六輕VOCs排放量之計算，數據資料皆有引用依據，「數字會說話」，絕對可以接受公評檢驗。任何影涉、詆毀雲林縣政府之言論，均非最好的公共政策討論方式，亦非人民之福。針對環保署沈署長於公務網站中指控縣府及蘇縣長部份，恐涉有加油添醋、蓄意攻訐、惡意毀謗、侮辱公署及訛誤之實，縣府呼籲環保署審慎妥處。並還給雲林縣民、專家學者及環保團體、業者一個理性、非情緒的政策討論空間。

副縣長施克和再次強調，公文內所提的數據都是有所本，公文只發給環保署並沒有給環保團體，何來誤導之說。如果真有爭議，連六輕也同意邀專家和相關單位進一步檢測釐清，訴諸登報道歉的做法並不恰當。

然而，雲林縣政府的回應，仍然沒有釐清4341公噸排放量究竟是六輕工業區許可排放量？還是實際排放量？另外，為何雲林縣政府沒有採用已修正的96年（VOCs）排放量只有3965公噸的數據，反而拿出所謂九千噸的舊數據的確實原因。