台南市家禽產業佔全國第三位，屠宰量每天高達近2萬隻，針對H7N9禽流感疫情台灣已有一起境外移入案例，市府雖率先成立疫情指揮中心，市議員賴惠員關心5月17日之後中央將嚴罰現宰業者，她擔心有業者會轉入地下，甚至流竄幅原廣大的山區私宰，屆時將成為防疫漏洞。她要求相關單位全面動起來，尤其要加強南市多處大型的餵養鴿子場所的環境衛生。

賴惠員議員指出，目前正值H7N9禽流感的危險期，市府雖早已成立疫情指揮中心，卻不知有無動起來？市長賴清德表示有。但，賴惠員議員說，全市有66處傳統市場，98個屠宰雞鴨的攤位，農委會鼓勵攤商配合禁宰活禽政策，補助每個攤商10萬元添購冷藏設備，及每隻雞鴨15元補助款，這項獎勵措施將至5月16日截止，17日之後將以嚴罰取代。

賴惠員議員表示，目前台南市合法的家禽電宰場僅有四處，其宰殺量並不足以供應大台南每日的供需量，因此包括山區的放山雞、隱身在各區市場周邊，甚至藏身在住宅區的現宰活禽攤商，早已存在多時，讓人擔心屆時禁宰活禽政策在5月17日開罰之後，這些現宰活禽攤商為規避追查，可能會四處流竄，並藏身於隱密的山區，將成為防疫的漏洞。

賴惠員議員還關心包括巴克禮公園、市立文化中心廣場、市立圖書館等多處大型民眾餵食鴿子的公共場所環境衛生問題，她要求環保局要加強清理。另，台南市37個行政區，原台南縣31個行政區公所上班的獸醫師，編制卻在動保處，也很不合理，且原台南市6個行政區，卻有4個行政區沒有獸醫師，僅有畜牧承辦人員，專業度不足，未來若有疫情，無法及時輔助，至於北區與安平區不僅沒有獸醫師，連畜牧承辦人員都沒有，她請市府進行全面檢討。